集装箱式主要采用反渗透膜法技术，反渗透膜法首先是将海水提取上来进行初步处理，降低海水浊度，然后用特种高压增压泵，是海水进入反渗透膜，反渗透膜具有高脱盐率、耐腐蚀、耐高压抗污染等特点。经反渗透膜处理后的海水，含盐量大大降低，出水水质符合相关卫生标准。

集装箱式的淡化方法比较反渗透法海水淡化与蒸馏法对比，膜法海水淡化只能利用电能，蒸馏法海水淡化利用热能和电能。所以反渗透淡化适合有电源的场合，蒸馏法适合有热源或电源的各种场合。但是随着反渗透膜性能的提高和能量回收装置的问世，其吨水耗电量逐渐降低。反渗透海水淡化经一次脱盐，能生产相当于自来水水质的淡化水。

虽然蒸馏法海水淡化水质较高，但反渗透技术仍具有较强的自身优势，如应用范围广，规模可大可小，建设周期短，不但可在陆地上建设，还适于在车辆、舰船、海上石油钻台、岛屿、野外等处使用。反渗透系统需要较好的预处理，才能保证出水水质。在海水淡化领域中，预处理是保证反渗透系统长期稳定运行的关键。

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